Полиморфизм интрона гена rps16 у представителей рода Malus Mill. и родственных видов семейства Rosaceae Juss.

CC BY - Creative Commons Attribution 4.0 International

RAI : 20.500.11925/873456

Год создания: 2015
Дата публикации в реестре: 25.08.2017


Авторы:

Авторы текста:

Описание:
<p>Интрон хлоропластного гена rps16, кодирующего рибосомный белок 16S, относится к интронам группы II, для которых характерна способность к автономному сплайсингу. Последовательность этого интрона может быть достаточно полиморфной и широко применяется для молекулярно-генетических исследований у различных семейств растений. Однако участки интрона, функционально значимые для сплайсинга и формирования вторичной структуры пре-мРНК у представителей семейства Rosaceae, в том числе рода Malus, на сегодняшний день не описаны.</p><p><strong>Целью работы</strong> была характеристика нуклеотидных последовательностей интрона rps16, оценка их полиморфизма и идентификация отдельных структурных элементов интрона, определяющих правильный сплайсинг гена rps16 у представителей рода Malus и родственных видов Rosaceae. Проведены амплификация, секвенирование и анализ полиморфизма нуклеотидных последовательностей интрона группы II хлоропластного гена rps16 у 32 видов рода Malus и 17 видов из других родов семейства Rosaceae. Показано, что у представителей рода Malus данный интрон имеет крайне низкий уровень вариабельности (1.5 %), так же как и у представителей рода Prunus, у которых полиморфизм интрона гена rps16 был несколько выше (2.25 %). В изученных последовательностях интрона гена rps16 были идентифицированы границы шести функциональных доменов, характерные для интронов группы II, а также сайты связыва- ния IBS/EBS. Определены уровни вариабельности последовательностей всех шести доменов и междоменных участков. Наиболее консервативными оказались домены V и VI, что может быть связано с ролью этих доменов в позиционировании всех структур премРНК и формировании каталитически активной пространственной структуры интрона. Таким образом, впервые изучен полиморфизм интрона хлоропластного гена rps16 у видов Malus и родственных видов Rosaceae. Идентифицированы границы всех шести функциональных доменов, характерные для интронов группы II, и сайты связывания IBS/EBS. Показано, что наиболее консервативными в последовательности интрона являются домены V и VI.</p>

Язык:
rus

Тип:
Научные статьи

Банк знаний:
Научные журналы на платформе Elpub

Источник:
Вавиловский журнал генетики и селекции




Я - автор

Вы можете подать заявку на авторство данного произведения, привязать его к своему аккаунту и выбрать правовой режим его использования.



Добавить в избранное Предложить изменения


Отправить претензию

Поделиться c друзьями:  


Тематически близкие работы 9
Порядок митохондриальных генов как дополнительный маркер в филогенетических исследованиях насекомых

За миллионы лет эволюции геномы современных насекомых накопили значительное количество мутаций. Геномные различия неко­ торых представителей класса Insecta, принадлежащих одному семейству или отряду, настолько велики, что могут завести в тупик при проведении филогенетических исследований и требуют использования нетрадиционных методов анализа. Из...


2017 | Шарко Ф. С.

Научные журналы на платформе Elpub | CC BY

Анализ полиморфизма экзона-4 гена VERNALIZATION-A1 у видов полиплоидной пшеницы

Одними из ключевых генов в селекции пшеницы, влияющих на адаптивность и урожайность культуры, являются гены VRN1. В недавних исследованиях установлена ассоциация полиморфизма нуклеотидной последовательности четвертого экзона гена VRN-A1 с вариабельностью количественных показателей ряда агрономически ценных признаков озимой пшеницы, таких как чув...


2017 | Мутерко А. Ф.

Научные журналы на платформе Elpub | CC BY

ПОЛИМОРФИЗМ И МЕЖВИДОВАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ГЕНА СУБЪЕДИНИЦЫ I ЦИТОХРОМОКСИДАЗЫ (COI) У ВИДОВ-ДВОЙНИКОВ A И B Anopheles messeae И An. beklemishevi (DIPTERA: CULICIDAE)

<p>Методом PCR-RFLP ITS2 определена видовая принадлежность 159 особей комплекса <em><span style="font-family: Times New Roman,Times New Roman; font-size: small;"><span style="font-family: Times New Roman,Times New Roman; font-size: small;">Anopheles maculipennis </span></span></em><span style="font-size: small;">из 5 локальностей Урала и Сибири....


2012 | Ваулин О. В.

Научные журналы на платформе Elpub | CC BY

Некоторые ограничения использования гена cytb митохондриальной ДНК как молекулярного маркера для филогенетических и популяционно- генетических исследований на примере рода Apodemus

<div class="page" title="Page 1"><div class="layoutArea"><div class="column"><p><span>Интерпретация сигнала гена </span><span>cytb </span><span>мтДНК как молекулярного маркера в филогенетических и популяционно-генетических исследованиях может быть осложнена суммарным влиянием параллельных мутаций (энтропией нуклеотидных последовательностей), ...


2015 | Лапинский А. Г.

Научные журналы на платформе Elpub | CC BY

ЭФФЕКТИВНОСТЬ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ ГЕНОВ BMY2, WAXY И ВНУТРЕННИХ ТРАНСКРИБИРУЕМЫХ СПЕЙСЕРОВ ГЕНОВ РИБОСОМНЫХ РНК В КАЧЕСТВЕ МАРКЕРОВ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ ВИДОВ РОДА ELYMUS

<em><em></em></em><p align="LEFT">Elymus <span style="font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;"><span style="font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;">L. – </span></span><span style="font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;" lang="JA"><span style="font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;" lang="JA">род семейст...


2014 | Шмаков Н. А.

Научные журналы на платформе Elpub | CC BY

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ МАРКЕРОВ ОРГАНЕЛЬНОЙ ДНК ДЛЯ АНАЛИЗА ФИЛОГЕОГРАФИИ ВОСТОЧНОЕВРОПЕЙСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ ЕЛИ ЕВРОПЕЙСКОЙ PICEA ABIES (L.) H. KARST.

<p align="LEFT">История формирования ареала ели европейской на территории Восточно<span style="font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;"><span style="font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;">-</span></span><span style="font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;"><span style="font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: sm...


2014 | Потокина Е. К.

Научные журналы на платформе Elpub | CC BY

ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ ИНТРОНА ПЛАСТИДНОГО ГЕНА TRNL У ВИДОВ FABOIDEAE (СЕМ. FABACEAE)

<p align="LEFT">Интрон<span style="font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;"><span style="font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;">, </span></span><span style="font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;"><span style="font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;">расположенный между первым и вторым нуклеотидами анти...


2014 | Дьяченко Е. А.

Научные журналы на платформе Elpub | CC BY

МОЛЕКУЛЯРНОЕ ДАТИРОВАНИЕ ВНУТРИВИДОВОЙ ДИФФЕРЕНЦИАЦИИ ГОРНОСТАЯ (MUSTELA ERMINEA) ПО ДАННЫМ ОБ ИЗМЕНЧИВОСТИ ГЕНА ND2 МИТОХОНДРИАЛЬНОГО ГЕНОМА

<p align="LEFT">Определены нуклеотидные последовательности гена второй субъединицы <span style="font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;"><span style="font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;">NADH-</span></span><span style="font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;"><span style="font-family: TimesNewRomanPSMT; font-siz...


2014 | Малярчук Б. А.

Научные журналы на платформе Elpub | CC BY

СРАВНИТЕЛЬНОЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ АЗИАТСКИХ ПОПУЛЯЦИЙ DROSOPHILA MERCATORUM (DIPTERA; DROSOPHILIDAE) ПО ФРАГМЕНТУ ГЕНА COI И УЧАСТКУ ITS1-ITS2 ГЕНОВ pРНК

<p align="LEFT">Вид неотропического происхождения<span style="color: #231f20; font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;"><span style="color: #231f20; font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;"><span style="color: #231f20; font-family: TimesNewRomanPSMT; font-size: small;">, </span></span></span><em><span style="color: #231f20; fo...


2014 | Иванников А. В.

Научные журналы на платформе Elpub | CC BY